Географы оценили работу

Цифровой гербарий МГУ представляет собой крупнейшую в России коллекцию оцифрованных образцов растений со свободным доступом. Сейчас на портале доступно 960 263 образца, привезенных из разных уголков планеты. Проект реализуется в рамках создания Национального банка-депозитария живых систем «Ноев ковчег» при поддержке Российского научного фонда.

Гербарий Московского университета — коллекция мирового значения, первое упоминание о ней относится еще к 1780 году. Здесь сосредоточены как ценнейшие исторические реликвии, связанные с именами Карла Линнея и Джеймса Кука, так и обширные материалы последующих исследователей флоры.

«Премия Русского географического общества — важное признание мультидисциплинарности нашего проекта, — рассказал “Стимулу” ведущий научный сотрудник кафедры геоботаники биологического факультета МГУ, руководитель направления “Растения” в проекте “Ноев ковчег” Алексей Серегин. — Цифровой гербарий необходим для решения задач на стыке наук о жизни, наук о земле и информатики. В этот раз географический компонент наших исследований получил безоговорочное признание российских географов в лице РГО. С другой стороны, эта награда — яркая запятая, а не точка в нашей работе. Перед нами открываются новые горизонты в области тотальной оцифровки данных о разнообразии растений страны и мира для решения научных, природоохранных и образовательных задач. Проект будет развиваться еще интенсивнее и, надеюсь, привлечет новых ученых в коллектив разработчиков».

Оцифровка коллекции растений МГУ начались под руководством Алексея Серегина в 2015 году. За четыре года работы ученым удалось создать первую в России цифровую коллекцию биоматериала такого масштаба. Сегодня это самый большой цифровой гербарий из тех, которыми располагают университеты мира.

«Московский университет обладает огромными коллекциями биологического материала, которые до недавнего времени были известны лишь узкому кругу специалистов. С началом реализации Национального проекта по созданию банка-депозитария живых систем “Ноев ковчег” мы инвентаризовали все биологические и медицинские коллекции университета и начали переводить их в открытую информационную систему, доступную онлайн каждому желающему из любой точки планеты, — рассказывает ректор МГУ академик Виктор Садовничий. — За четыре года мы полностью отсканировали фонды нашего гербария и создали огромный проект “Цифровой гербарий” Московского университета, который уже включает в себя почти миллион образцов. И этой цифровой коллекцией стали пользоваться тысячи ученых как из России, так и из стран ближнего и дальнего зарубежья. Цифровой гербарий стал кладезем материла для различного рода исследований. Мы проделали титаническую работу по оцифровке фондов».

Taxus cuspidata (Тис остроконечный, Тисс остроконечный), Сибирь, Дальний Восток (Россия), Гербарий Главного ботанического сада Академии наук СССР

plant.depo.msu.ru

Коллекция Цифрового гербария МГУ состоит из трех взаимосвязанных блоков: библиотеки высококачественных изображений гербарных образцов; базы данных текстовой информации, содержащейся в этикетках; геоинформационной системы с координатами мест сбора гербарных образцов.

В октябре 2016 года программисты НИИ физико-химической биологии имени А. Н. Белозерского МГУ запустили портал Цифрового гербария. С этого момента отсканированные изображения гербарных образцов стали общедоступными.

Кроме того, снабженные точными географическими координатами образцы из Цифрового гербария были загружены в международную базу данных о биоразнообразии Global Biodiversity Information Facility (GBIF). В ноябре 2017 года в базу интегрировали 786 тыс. образцов, после чего Московский университет стал главным поставщиком данных о разнообразии растений России и отдельных стран зарубежья.

«За 2018 год мы отослали несколько сотен образцов ДНК сухих растений нашего гербария, — рассказал Алексей Серегин. — Ученые из Бельгии, Германии, Швеции, Греции, США, Чехии используют их сейчас в своей работе для изучения разнообразия растений Земли и их эволюции. О существовании этих образцов коллеги узнали именно благодаря порталу Цифрового гербария МГУ. По итогам анализа ДНК в наших фондах обнаружено несколько новых для науки видов, в том числе очень редких. Другой пример — страны, где ботаники почти не работали. По итогам оцифровки и аккуратной инвентаризации оказалось, что Гербарий МГУ — одно из основных хранилищ биологического материала из КНДР, Мали или Сейшельских островов. Кто бы мог подумать?»

Цифровой гербарий Московского университета входит в десятку ведущих баз данных по флорам стран Африки, Южной и Юго-Восточной Азии. Эти районы считаются труднодоступными для исследователей, и их биоразнообразие до сих пор мало изучено.