У корабля непростая судьба: заложен он был еще в июне 2005 года, но потом решением Минобороны строительство приостановили до пуска в опытную эксплуатацию головной субмарины. Возобновили работы только в 2013-м. «Вынужденная пауза позволила нам максимально учесть опыт эксплуатации на Северном флоте первого корабля этого проекта — подлодки “Санкт-Петербург”», — отметил генеральный директор АО «Адмиралтейские верфи» Александр Бузаков.
Головное судно проекта 677 было заложено еще в 1997 году, а передача «Санкт-Петербурга» в состав ВМФ России состоялась только в 2010-м. Однако корабль так и не встал в боевой строй из-за многочисленных технических проблем. Военные моряки обнаружили на лодке массу недоделок: были проблемы с гидроакустическим комплексом, программным обеспечением, главной энергетической установкой и многими другими системами. Официально «Санкт-Петербург» остается в опытовой эксплуатации, которую планируется завершить только в 2019 году. Фактически субмарина стала стендом, на котором отрабатывались более сотни новейших опытно-конструкторских работ.
Большая дизель-электрическая подводная лодка проекта 677 «Лада» создавалась в качестве универсальной замены субмарин проекта 877 «Палтус» («Варшавянка»). Она относится к четвертому поколению неатомных субмарин «Лада». Проект был разработан Центральным конструкторским бюро морской техники «Рубин» в 1990-х годах под руководством главного конструктора Юрия Кормилицина.