Суперкомпьютерные центры подключены к Национальной исследовательской компьютерной сети России (НИКС). Она создана по заданию Минобрнауки России в 2019 году в результате интеграции функционировавших на протяжении 25 лет отраслевых научно-образовательных телекоммуникационных сетей — федеральной университетской компьютерной сети RUNNet (Russian UNiversity Network) и сети организаций Российской академии наук RASNet (Russian Academy of Science Network). Телекоммуникационные узлы НИКС есть более чем в 40 регионах России, она предоставляет услуги более чем 150 организациям высшего образования и науки. Общее количество пользователей сети, по независимым экспертным оценкам, превышает три миллиона человек, что делает ее не только крупнейшей научно-образовательной сетью страны, но и одной из крупнейших компьютерных сетей России и мира. Администратор сети — Межведомственный суперкомпьютерный центр (МСЦ) РАН.
«В этом году планируется подключить к ней 40 процентов от общего числа ведущих организаций и все 10 суперкомпьютерных центров страны. К 2024 году к системе будут подключены абсолютно все научные и образовательные организации высшего образования», — заявил заместитель председателя правительства России Дмитрий Чернышенко, который присутствовал на церемонии подписания.